Een dramatische wending in de wereld van de Smurfen! Gargamel realiseert zich dat hij op het verkeerde spoor zit: door de Smurfen gevangen te nemen zal hij nooit de Steen der Wijzen kunnen maken. Na een korte maar begrijpelijke depressie besluit de tovenaar een bocht te maken. Hij wil onze blauwe vrienden helpen een nieuw gevaar het hoofd te bieden: Pepijn Paljas, een bioloog die erop gebrand is de Smurfen te bestuderen... met alle middelen die daarvoor nodig zijn. Maar kunnen ze Gargamel wel...

Gargamel is erin geslaagd een kraai te laten spreken in de hoop dat het dier hem vertelt waar het Smurfendorp zich bevindt. Het Smurfendorp is in gevaar. Maar de sprekende kraai vergist zich en botst per toeval op het dorp van de meisjes… een onverwachte maar niet minder onrustwekkende wending!

Na hun avonturen op het dolende eiland komen Pepermunt, Smurfstorm en Smurfbloesem steeds dichter bij het land van de Smurfende Stenen. Ze nemen afscheid van hun hondstrouwe gezel Bernardo, en trekken verder in het gezelschap van niemand minder dan betweterige en babbelzieke Brilsmurf. Samen met Spin gaat ons viertal op zoek naar het middel om Smurfwilgje te redden... de redding is nabij, maar de tijd dringt!